Export a dataset together with reference (DataCite and Dublin Core) metadata.
Arguments
- ds
A dataset object.
- file
A (path to) a file where to export the dataset object.
- filetype
Currently only
'csv'is implemented.- ...
Further parameters to be passed on to exporting functions. See details.
Details
This function is a wrapper around the exporting functions.It implements
file exports in a way that the resulting exported file contains reference metadata.dataset_export_csv is a wrapper around utils::write.csv.
Use ... to pass on argument to that function.
Examples
my_iris_dataset <- dataset(
x = iris,
Dimensions = NULL,
Measures = c("Sepal.Length", "Sepal.Width", "Petal.Length", "Petal.Width" ),
Attributes = "Species",
Title = "Iris Dataset"
)
my_iris_dataset <- dublincore_add(
x = my_iris_dataset,
Creator = person("Edgar", "Anderson", role = "aut"),
Publisher = "American Iris Society",
Source = "https://doi.org/10.1111/j.1469-1809.1936.tb02137.x",
Date = 1935,
Language = "en"
)
dataset_export_csv(my_iris_dataset, file = file.path(tempdir(), "my_iris.csv"))
# \donttest{
read.csv(file.path(tempdir(), "my_iris.csv"), skip=20)
#> Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
#> 1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa
#> 2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa
#> 3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
#> 4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa
#> 5 5.0 3.6 1.4 0.2 setosa
#> 6 5.4 3.9 1.7 0.4 setosa
#> 7 4.6 3.4 1.4 0.3 setosa
#> 8 5.0 3.4 1.5 0.2 setosa
#> 9 4.4 2.9 1.4 0.2 setosa
#> 10 4.9 3.1 1.5 0.1 setosa
#> 11 5.4 3.7 1.5 0.2 setosa
#> 12 4.8 3.4 1.6 0.2 setosa
#> 13 4.8 3.0 1.4 0.1 setosa
#> 14 4.3 3.0 1.1 0.1 setosa
#> 15 5.8 4.0 1.2 0.2 setosa
#> 16 5.7 4.4 1.5 0.4 setosa
#> 17 5.4 3.9 1.3 0.4 setosa
#> 18 5.1 3.5 1.4 0.3 setosa
#> 19 5.7 3.8 1.7 0.3 setosa
#> 20 5.1 3.8 1.5 0.3 setosa
#> 21 5.4 3.4 1.7 0.2 setosa
#> 22 5.1 3.7 1.5 0.4 setosa
#> 23 4.6 3.6 1.0 0.2 setosa
#> 24 5.1 3.3 1.7 0.5 setosa
#> 25 4.8 3.4 1.9 0.2 setosa
#> 26 5.0 3.0 1.6 0.2 setosa
#> 27 5.0 3.4 1.6 0.4 setosa
#> 28 5.2 3.5 1.5 0.2 setosa
#> 29 5.2 3.4 1.4 0.2 setosa
#> 30 4.7 3.2 1.6 0.2 setosa
#> 31 4.8 3.1 1.6 0.2 setosa
#> 32 5.4 3.4 1.5 0.4 setosa
#> 33 5.2 4.1 1.5 0.1 setosa
#> 34 5.5 4.2 1.4 0.2 setosa
#> 35 4.9 3.1 1.5 0.2 setosa
#> 36 5.0 3.2 1.2 0.2 setosa
#> 37 5.5 3.5 1.3 0.2 setosa
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#> 40 5.1 3.4 1.5 0.2 setosa
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#> 47 5.1 3.8 1.6 0.2 setosa
#> 48 4.6 3.2 1.4 0.2 setosa
#> 49 5.3 3.7 1.5 0.2 setosa
#> 50 5.0 3.3 1.4 0.2 setosa
#> 51 7.0 3.2 4.7 1.4 versicolor
#> 52 6.4 3.2 4.5 1.5 versicolor
#> 53 6.9 3.1 4.9 1.5 versicolor
#> 54 5.5 2.3 4.0 1.3 versicolor
#> 55 6.5 2.8 4.6 1.5 versicolor
#> 56 5.7 2.8 4.5 1.3 versicolor
#> 57 6.3 3.3 4.7 1.6 versicolor
#> 58 4.9 2.4 3.3 1.0 versicolor
#> 59 6.6 2.9 4.6 1.3 versicolor
#> 60 5.2 2.7 3.9 1.4 versicolor
#> 61 5.0 2.0 3.5 1.0 versicolor
#> 62 5.9 3.0 4.2 1.5 versicolor
#> 63 6.0 2.2 4.0 1.0 versicolor
#> 64 6.1 2.9 4.7 1.4 versicolor
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#> 66 6.7 3.1 4.4 1.4 versicolor
#> 67 5.6 3.0 4.5 1.5 versicolor
#> 68 5.8 2.7 4.1 1.0 versicolor
#> 69 6.2 2.2 4.5 1.5 versicolor
#> 70 5.6 2.5 3.9 1.1 versicolor
#> 71 5.9 3.2 4.8 1.8 versicolor
#> 72 6.1 2.8 4.0 1.3 versicolor
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#> 74 6.1 2.8 4.7 1.2 versicolor
#> 75 6.4 2.9 4.3 1.3 versicolor
#> 76 6.6 3.0 4.4 1.4 versicolor
#> 77 6.8 2.8 4.8 1.4 versicolor
#> 78 6.7 3.0 5.0 1.7 versicolor
#> 79 6.0 2.9 4.5 1.5 versicolor
#> 80 5.7 2.6 3.5 1.0 versicolor
#> 81 5.5 2.4 3.8 1.1 versicolor
#> 82 5.5 2.4 3.7 1.0 versicolor
#> 83 5.8 2.7 3.9 1.2 versicolor
#> 84 6.0 2.7 5.1 1.6 versicolor
#> 85 5.4 3.0 4.5 1.5 versicolor
#> 86 6.0 3.4 4.5 1.6 versicolor
#> 87 6.7 3.1 4.7 1.5 versicolor
#> 88 6.3 2.3 4.4 1.3 versicolor
#> 89 5.6 3.0 4.1 1.3 versicolor
#> 90 5.5 2.5 4.0 1.3 versicolor
#> 91 5.5 2.6 4.4 1.2 versicolor
#> 92 6.1 3.0 4.6 1.4 versicolor
#> 93 5.8 2.6 4.0 1.2 versicolor
#> 94 5.0 2.3 3.3 1.0 versicolor
#> 95 5.6 2.7 4.2 1.3 versicolor
#> 96 5.7 3.0 4.2 1.2 versicolor
#> 97 5.7 2.9 4.2 1.3 versicolor
#> 98 6.2 2.9 4.3 1.3 versicolor
#> 99 5.1 2.5 3.0 1.1 versicolor
#> 100 5.7 2.8 4.1 1.3 versicolor
#> 101 6.3 3.3 6.0 2.5 virginica
#> 102 5.8 2.7 5.1 1.9 virginica
#> 103 7.1 3.0 5.9 2.1 virginica
#> 104 6.3 2.9 5.6 1.8 virginica
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#> 106 7.6 3.0 6.6 2.1 virginica
#> 107 4.9 2.5 4.5 1.7 virginica
#> 108 7.3 2.9 6.3 1.8 virginica
#> 109 6.7 2.5 5.8 1.8 virginica
#> 110 7.2 3.6 6.1 2.5 virginica
#> 111 6.5 3.2 5.1 2.0 virginica
#> 112 6.4 2.7 5.3 1.9 virginica
#> 113 6.8 3.0 5.5 2.1 virginica
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#> 116 6.4 3.2 5.3 2.3 virginica
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#> 120 6.0 2.2 5.0 1.5 virginica
#> 121 6.9 3.2 5.7 2.3 virginica
#> 122 5.6 2.8 4.9 2.0 virginica
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#> 125 6.7 3.3 5.7 2.1 virginica
#> 126 7.2 3.2 6.0 1.8 virginica
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#> 132 7.9 3.8 6.4 2.0 virginica
#> 133 6.4 2.8 5.6 2.2 virginica
#> 134 6.3 2.8 5.1 1.5 virginica
#> 135 6.1 2.6 5.6 1.4 virginica
#> 136 7.7 3.0 6.1 2.3 virginica
#> 137 6.3 3.4 5.6 2.4 virginica
#> 138 6.4 3.1 5.5 1.8 virginica
#> 139 6.0 3.0 4.8 1.8 virginica
#> 140 6.9 3.1 5.4 2.1 virginica
#> 141 6.7 3.1 5.6 2.4 virginica
#> 142 6.9 3.1 5.1 2.3 virginica
#> 143 5.8 2.7 5.1 1.9 virginica
#> 144 6.8 3.2 5.9 2.3 virginica
#> 145 6.7 3.3 5.7 2.5 virginica
#> 146 6.7 3.0 5.2 2.3 virginica
#> 147 6.3 2.5 5.0 1.9 virginica
#> 148 6.5 3.0 5.2 2.0 virginica
#> 149 6.2 3.4 5.4 2.3 virginica
#> 150 5.9 3.0 5.1 1.8 virginica
read.csv(file.path(tempdir(), "my_iris.csv"))
#> Property value
#> 1 dimensions
#> 2 measures Sepal.Length|Sepal.Width|Petal.Length|Petal.Width
#> 3 attributes Species
#> 4 Type resourceType=DCMITYPE:Dataset|resourceTypeGeneral=Dataset
#> 5 Title Iris Dataset
#> 6 Size 16.27 kB [15.89 KiB]
#> 7 Date 2022-12-15
#> 8 Creator Edgar Anderson [aut]
#> 9 Source https://doi.org/10.1111/j.1469-1809.1936.tb02137.x
#> 10 Publisher American Iris Society
#> 11 Language eng
#> 12 Issued <NA>
#> 13 <NA> <NA>
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#> 15 <NA> <NA>
#> 16 <NA> <NA>
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#> 18 <NA> <NA>
#> 19 <NA> <NA>
#> 20 Sepal.Length Sepal.Width
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#> 24 4.6 3.1
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#> 168 6.5 3
#> 169 6.2 3.4
#> 170 5.9 3
#> V1 V2 V3
#> 1 <NA> <NA> <NA>
#> 2 <NA> <NA> <NA>
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#> 17 <NA> <NA> <NA>
#> 18 <NA> <NA> <NA>
#> 19 <NA> <NA> <NA>
#> 20 Petal.Length Petal.Width Species
#> 21 1.4 0.2 setosa
#> 22 1.4 0.2 setosa
#> 23 1.3 0.2 setosa
#> 24 1.5 0.2 setosa
#> 25 1.4 0.2 setosa
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#> 27 1.4 0.3 setosa
#> 28 1.5 0.2 setosa
#> 29 1.4 0.2 setosa
#> 30 1.5 0.1 setosa
#> 31 1.5 0.2 setosa
#> 32 1.6 0.2 setosa
#> 33 1.4 0.1 setosa
#> 34 1.1 0.1 setosa
#> 35 1.2 0.2 setosa
#> 36 1.5 0.4 setosa
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#> 39 1.7 0.3 setosa
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#> 47 1.6 0.4 setosa
#> 48 1.5 0.2 setosa
#> 49 1.4 0.2 setosa
#> 50 1.6 0.2 setosa
#> 51 1.6 0.2 setosa
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#> 54 1.4 0.2 setosa
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#> 56 1.2 0.2 setosa
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#> 62 1.3 0.3 setosa
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#> 68 1.4 0.2 setosa
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#> 73 4.9 1.5 versicolor
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#> 78 3.3 1 versicolor
#> 79 4.6 1.3 versicolor
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